自定义 C++和 CUDA 扩展
创建于:2025 年 4 月 1 日 | 最后更新:2025 年 4 月 1 日 | 最后验证:2024 年 11 月 5 日
作者:彼得·戈尔茨伯勒
警告
本教程自 PyTorch 2.4 版本起已弃用。请参阅 PyTorch 自定义算子,获取关于使用自定义 C++/CUDA 扩展扩展 PyTorch 的最新、最全面的指南。
PyTorch 提供了大量与神经网络、任意张量代数、数据处理和其他目的相关的操作。然而,您可能仍然需要更定制化的操作。例如,您可能想使用您在论文中找到的新颖激活函数,或者实现您作为研究工作的一部分开发的操作。
在 PyTorch 中集成此类自定义操作的最简单方法是将它用 Python 编写,并扩展 Function
和 Module
,如这里所述。这为您提供了自动微分(让您免于编写导数函数)的全部功能,以及 Python 的通常表现力。然而,有时您的操作可能更适合用 C++实现。例如,如果您的代码在模型中被频繁调用,或者即使调用次数很少也很昂贵,那么您的代码可能需要非常快。另一个可能的原因是它依赖于或与 C 或 C++库交互。为了解决这些问题,PyTorch 提供了一个非常简单的方式来编写自定义 C++扩展。
C++扩展是我们开发的一种机制,允许用户(您)创建定义在源代码之外的 PyTorch 运算符,即与 PyTorch 后端分离。这种方法与原生 PyTorch 操作的实现方式不同。C++扩展旨在让您在集成操作与 PyTorch 后端时省去大部分样板代码,同时为您的 PyTorch 项目提供高度灵活性。尽管如此,一旦您将操作定义为 C++扩展,将其转换为原生 PyTorch 函数主要是一个代码组织问题,如果您决定将操作贡献到上游,您可以在之后处理这个问题。
动机和示例
本笔记的其余部分将介绍编写和使用 C++(和 CUDA)扩展的实际示例。如果您正在被追赶,或者如果今天结束时您没有完成这个运算符就会被解雇,您可以跳过本节,直接查看下一节的实现细节。
假设你发明了一种新的循环单元,发现它的性能优于现有技术。这个循环单元类似于 LSTM,但不同之处在于它没有遗忘门,并使用指数线性单元(ELU)作为其内部激活函数。因为这个单元从不忘记,我们将它称为 LLTM,或长长时记忆单元。
LLTM 与普通 LSTM 的不同之处足够显著,以至于我们不能配置 PyTorch 的 LSTMCell
来满足我们的需求,因此我们需要创建一个自定义单元。这个方法的第一步也是最简单的一步——在所有情况下都可能是一个好的第一步——就是使用纯 PyTorch 和 Python 实现我们想要的功能。为此,我们需要继承 torch.nn.Module
并实现 LLTM 的前向传递。这看起来可能像这样:
class LLTM(torch.nn.Module):
def __init__(self, input_features, state_size):
super(LLTM, self).__init__()
self.input_features = input_features
self.state_size = state_size
# 3 * state_size for input gate, output gate and candidate cell gate.
# input_features + state_size because we will multiply with [input, h].
self.weights = torch.nn.Parameter(
torch.empty(3 * state_size, input_features + state_size))
self.bias = torch.nn.Parameter(torch.empty(3 * state_size))
self.reset_parameters()
def reset_parameters(self):
stdv = 1.0 / math.sqrt(self.state_size)
for weight in self.parameters():
weight.data.uniform_(-stdv, +stdv)
def forward(self, input, state):
old_h, old_cell = state
X = torch.cat([old_h, input], dim=1)
# Compute the input, output and candidate cell gates with one MM.
gate_weights = F.linear(X, self.weights, self.bias)
# Split the combined gate weight matrix into its components.
gates = gate_weights.chunk(3, dim=1)
input_gate = torch.sigmoid(gates[0])
output_gate = torch.sigmoid(gates[1])
# Here we use an ELU instead of the usual tanh.
candidate_cell = F.elu(gates[2])
# Compute the new cell state.
new_cell = old_cell + candidate_cell * input_gate
# Compute the new hidden state and output.
new_h = torch.tanh(new_cell) * output_gate
return new_h, new_cell
我们可以使用它,就像预期的那样:
import torch
X = torch.randn(batch_size, input_features)
h = torch.randn(batch_size, state_size)
C = torch.randn(batch_size, state_size)
rnn = LLTM(input_features, state_size)
new_h, new_C = rnn(X, (h, C))
当然,如果可能且合理,你应该使用这种方法来扩展 PyTorch。由于 PyTorch 为 CPU 和 GPU 提供了高度优化的操作实现,由 NVIDIA cuDNN、Intel MKL 或 NNPACK 等库提供支持,上述 PyTorch 代码通常已经足够快。然而,我们也可以看到,在特定情况下,还有进一步提升性能的空间。最明显的原因是 PyTorch 不了解你正在实现的算法。它只知道你用来构建算法的各个操作。因此,PyTorch 必须逐个执行你的操作。由于每个操作的实现(或内核)的调用(可能涉及 CUDA 内核的启动)都有一定的开销,这种开销在许多函数调用中可能会变得相当显著。此外,运行我们代码的 Python 解释器本身也可能减慢我们的程序。
因此,加快速度的一个明确方法就是用 C++(或 CUDA)重写部分代码,并将特定操作组合融合在一起。融合意味着将许多函数的实现合并成一个函数,这可以减少内核调用次数,并利用我们对全局数据流可见性提高而进行的其他优化。
让我们看看如何使用 C++扩展来实现 LLTM 的融合版本。我们将首先使用 ATen 库(PyTorch 后端的大部分功能都由它提供)用纯 C++编写它,看看它如何轻松地将我们的 Python 代码翻译过来。然后,我们将通过将模型的部分代码移至 CUDA 内核来进一步提高速度,以利用 GPU 提供的巨大并行性。
编写 C++扩展
C++扩展有两种形式:它们可以“预编译”构建,或者“即时”编译。我们将首先介绍第一种方法,稍后讨论第二种方法。
使用 setuptools
构建
对于“提前构建”版本,我们通过编写一个使用 setuptools 编译我们的 C++ 代码的 setup.py
脚本来构建我们的 C++ 扩展。对于 LLTM,看起来就像这样:
from setuptools import setup, Extension
from torch.utils import cpp_extension
setup(name='lltm_cpp',
ext_modules=[cpp_extension.CppExtension('lltm_cpp', ['lltm.cpp'])],
cmdclass={'build_ext': cpp_extension.BuildExtension})
在此代码中, CppExtension
是一个便利包装器,它围绕 setuptools.Extension
传递正确的包含路径,并将扩展的语言设置为 C++。等效的纯 setuptools
代码将简单地是:
Extension(
name='lltm_cpp',
sources=['lltm.cpp'],
include_dirs=cpp_extension.include_paths(),
language='c++')
BuildExtension
执行多个必要的配置步骤和检查,并在混合 C++/CUDA 扩展的情况下管理混合编译。这就是我们现在需要了解的关于构建 C++ 扩展的所有内容!现在让我们看看我们的 C++ 扩展的实现,它涉及到 lltm.cpp
。
编写 C++ Op 操作符
让我们开始用 C++ 实现 LLTM!反向传播过程中我们需要一个函数,即 sigmoid 的导数。这段代码足够小,可以讨论编写 C++ 扩展时我们可用的整体环境:
#include <torch/extension.h>
#include <iostream>
torch::Tensor d_sigmoid(torch::Tensor z) {
auto s = torch::sigmoid(z);
return (1 - s) * s;
}
<torch/extension.h>
是包含编写 C++ 扩展所需所有 PyTorch 代码段的头文件。它包括:
ATen 库,这是我们进行张量计算的主要 API,
pybind11,这是我们创建 C++代码 Python 绑定的方式,
管理 ATen 与 pybind11 之间交互细节的头文件。
d_sigmoid()
的实现展示了如何使用 ATen API。PyTorch 的 tensor 和 variable 接口是自动从 ATen 库生成的,因此我们可以将我们的 Python 实现 1:1 地翻译成 C++。我们所有计算的主要数据类型将是 torch::Tensor
。其完整 API 可以在此处检查。注意,我们还可以包含 <iostream>
或任何其他 C 或 C++头文件——我们拥有 C++11 的全部功能。
注意,CUDA-11.5 nvcc 在 Windows 上解析 torch/extension.h 时将遇到内部编译错误。为了解决这个问题,将 Python 绑定逻辑移动到纯 C++文件中。示例用法:
#include <ATen/ATen.h>
at::Tensor SigmoidAlphaBlendForwardCuda(....)
代替:
#include <torch/extension.h>
torch::Tensor SigmoidAlphaBlendForwardCuda(...)
目前在此处有一个针对 nvcc 错误的开放问题。完整的解决方案代码示例在此。
前向传递 ¶
接下来我们可以将整个前向传递端口到 C++:
#include <vector>
std::vector<at::Tensor> lltm_forward(
torch::Tensor input,
torch::Tensor weights,
torch::Tensor bias,
torch::Tensor old_h,
torch::Tensor old_cell) {
auto X = torch::cat({old_h, input}, /*dim=*/1);
auto gate_weights = torch::addmm(bias, X, weights.transpose(0, 1));
auto gates = gate_weights.chunk(3, /*dim=*/1);
auto input_gate = torch::sigmoid(gates[0]);
auto output_gate = torch::sigmoid(gates[1]);
auto candidate_cell = torch::elu(gates[2], /*alpha=*/1.0);
auto new_cell = old_cell + candidate_cell * input_gate;
auto new_h = torch::tanh(new_cell) * output_gate;
return {new_h,
new_cell,
input_gate,
output_gate,
candidate_cell,
X,
gate_weights};
}
向后传递
目前 C++扩展 API 没有提供自动生成反向函数的方法。因此,我们还需要实现 LLTM 的反向传递,该传递计算正向传递中损失相对于每个输入的导数。最终,我们将正向和反向函数放入 torch.autograd.Function
中,以创建一个漂亮的 Python 绑定。反向函数稍微复杂一些,所以我们将不深入探讨代码(如果您感兴趣,Alex Graves 的论文是了解这方面信息的良好读物):
// tanh'(z) = 1 - tanh^2(z)
torch::Tensor d_tanh(torch::Tensor z) {
return 1 - z.tanh().pow(2);
}
// elu'(z) = relu'(z) + { alpha * exp(z) if (alpha * (exp(z) - 1)) < 0, else 0}
torch::Tensor d_elu(torch::Tensor z, torch::Scalar alpha = 1.0) {
auto e = z.exp();
auto mask = (alpha * (e - 1)) < 0;
return (z > 0).type_as(z) + mask.type_as(z) * (alpha * e);
}
std::vector<torch::Tensor> lltm_backward(
torch::Tensor grad_h,
torch::Tensor grad_cell,
torch::Tensor new_cell,
torch::Tensor input_gate,
torch::Tensor output_gate,
torch::Tensor candidate_cell,
torch::Tensor X,
torch::Tensor gate_weights,
torch::Tensor weights) {
auto d_output_gate = torch::tanh(new_cell) * grad_h;
auto d_tanh_new_cell = output_gate * grad_h;
auto d_new_cell = d_tanh(new_cell) * d_tanh_new_cell + grad_cell;
auto d_old_cell = d_new_cell;
auto d_candidate_cell = input_gate * d_new_cell;
auto d_input_gate = candidate_cell * d_new_cell;
auto gates = gate_weights.chunk(3, /*dim=*/1);
d_input_gate *= d_sigmoid(gates[0]);
d_output_gate *= d_sigmoid(gates[1]);
d_candidate_cell *= d_elu(gates[2]);
auto d_gates =
torch::cat({d_input_gate, d_output_gate, d_candidate_cell}, /*dim=*/1);
auto d_weights = d_gates.t().mm(X);
auto d_bias = d_gates.sum(/*dim=*/0, /*keepdim=*/true);
auto d_X = d_gates.mm(weights);
const auto state_size = grad_h.size(1);
auto d_old_h = d_X.slice(/*dim=*/1, 0, state_size);
auto d_input = d_X.slice(/*dim=*/1, state_size);
return {d_old_h, d_input, d_weights, d_bias, d_old_cell};
}
绑定到 Python
一旦您使用 C++和 ATen 编写了操作,您就可以使用 pybind11 以非常简单的方式将您的 C++函数或类绑定到 Python 中。您在 PyTorch C++扩展中关于这部分的问题或问题将主要由 pybind11 文档解决。
对于我们的扩展,必要的绑定代码仅占用四行:
PYBIND11_MODULE(TORCH_EXTENSION_NAME, m) {
m.def("forward", &lltm_forward, "LLTM forward");
m.def("backward", &lltm_backward, "LLTM backward");
}
这里有一点需要注意,即宏 TORCH_EXTENSION_NAME
。Torch 扩展构建将根据你在 setup.py
脚本中给出的扩展名来定义它。在这种情况下, TORCH_EXTENSION_NAME
的值将是“lltm_cpp”。这是为了避免在两个地方(构建脚本和你的 C++ 代码)维护扩展名的名称,因为这两个名称之间的不匹配可能导致难以追踪和解决的问题。
使用您的扩展
现在,我们已经准备好在 PyTorch 中导入我们的扩展。此时,您的目录结构可能如下所示:
pytorch/
lltm-extension/
lltm.cpp
setup.py
现在,运行 python setup.py install
来构建和安装您的扩展。这应该看起来像这样:
running install
running bdist_egg
running egg_info
creating lltm_cpp.egg-info
writing lltm_cpp.egg-info/PKG-INFO
writing dependency_links to lltm_cpp.egg-info/dependency_links.txt
writing top-level names to lltm_cpp.egg-info/top_level.txt
writing manifest file 'lltm_cpp.egg-info/SOURCES.txt'
reading manifest file 'lltm_cpp.egg-info/SOURCES.txt'
writing manifest file 'lltm_cpp.egg-info/SOURCES.txt'
installing library code to build/bdist.linux-x86_64/egg
running install_lib
running build_ext
building 'lltm_cpp' extension
creating build
creating build/temp.linux-x86_64-3.7
gcc -pthread -B ~/local/miniconda/compiler_compat -Wl,--sysroot=/ -Wsign-compare -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -I~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/torch/include -I~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/torch/include/torch/csrc/api/include -I~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/torch/include/TH -I~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/torch/include/THC -I~/local/miniconda/include/python3.7m -c lltm.cpp -o build/temp.linux-x86_64-3.7/lltm.o -DTORCH_API_INCLUDE_EXTENSION_H -DTORCH_EXTENSION_NAME=lltm_cpp -D_GLIBCXX_USE_CXX11_ABI=1 -std=c++11
cc1plus: warning: command line option ‘-Wstrict-prototypes’ is valid for C/ObjC but not for C++
creating build/lib.linux-x86_64-3.7
g++ -pthread -shared -B ~/local/miniconda/compiler_compat -L~/local/miniconda/lib -Wl,-rpath=~/local/miniconda/lib -Wl,--no-as-needed -Wl,--sysroot=/ build/temp.linux-x86_64-3.7/lltm.o -o build/lib.linux-x86_64-3.7/lltm_cpp.cpython-37m-x86_64-linux-gnu.so
creating build/bdist.linux-x86_64
creating build/bdist.linux-x86_64/egg
copying build/lib.linux-x86_64-3.7/lltm_cpp.cpython-37m-x86_64-linux-gnu.so -> build/bdist.linux-x86_64/egg
creating stub loader for lltm_cpp.cpython-37m-x86_64-linux-gnu.so
byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/lltm_cpp.py to lltm_cpp.cpython-37.pyc
creating build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
copying lltm_cpp.egg-info/PKG-INFO -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
copying lltm_cpp.egg-info/SOURCES.txt -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
copying lltm_cpp.egg-info/dependency_links.txt -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
copying lltm_cpp.egg-info/top_level.txt -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
writing build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO/native_libs.txt
zip_safe flag not set; analyzing archive contents...
__pycache__.lltm_cpp.cpython-37: module references __file__
creating 'dist/lltm_cpp-0.0.0-py3.7-linux-x86_64.egg' and adding 'build/bdist.linux-x86_64/egg' to it
removing 'build/bdist.linux-x86_64/egg' (and everything under it)
Processing lltm_cpp-0.0.0-py3.7-linux-x86_64.egg
removing '~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/lltm_cpp-0.0.0-py3.7-linux-x86_64.egg' (and everything under it)
creating ~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/lltm_cpp-0.0.0-py3.7-linux-x86_64.egg
Extracting lltm_cpp-0.0.0-py3.7-linux-x86_64.egg to ~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages
lltm-cpp 0.0.0 is already the active version in easy-install.pth
Installed ~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/lltm_cpp-0.0.0-py3.7-linux-x86_64.egg
Processing dependencies for lltm-cpp==0.0.0
Finished processing dependencies for lltm-cpp==0.0.0
关于编译器的一个小贴士:由于 ABI 版本化问题,您用于构建 C++扩展的编译器必须与 PyTorch 构建时使用的编译器兼容。在实践中,这意味着您必须在 Linux 上使用 GCC 4.9 及以上版本。对于 Ubuntu 16.04 和其他较新的 Linux 发行版,这应该是默认编译器。在 MacOS 上,您必须使用 clang(它没有 ABI 版本化问题)。在最坏的情况下,您可以使用自己的编译器从源代码构建 PyTorch,然后使用相同的编译器构建扩展。
一旦您的扩展构建完成,您只需在 Python 中使用您在 setup.py
脚本中指定的名称导入它即可。只需确保先 import
torch
,因为这将解决动态链接器必须看到的某些符号:
In [1]: import torch
In [2]: import lltm_cpp
In [3]: lltm_cpp.forward
Out[3]: <function lltm.PyCapsule.forward>
如果我们在函数或模块上调用 help()
,我们可以看到其签名与我们的 C++代码匹配:
In[4] help(lltm_cpp.forward)
forward(...) method of builtins.PyCapsule instance
forward(arg0: torch::Tensor, arg1: torch::Tensor, arg2: torch::Tensor, arg3: torch::Tensor, arg4: torch::Tensor) -> List[torch::Tensor]
LLTM forward
由于我们现在能够从 Python 调用我们的 C++ 函数,我们可以用 torch.autograd.Function
和 torch.nn.Module
将它们包装起来,使它们成为 PyTorch 的一等公民:
import math
import torch
# Our module!
import lltm_cpp
class LLTMFunction(torch.autograd.Function):
@staticmethod
def forward(ctx, input, weights, bias, old_h, old_cell):
outputs = lltm_cpp.forward(input, weights, bias, old_h, old_cell)
new_h, new_cell = outputs[:2]
variables = outputs[1:] + [weights]
ctx.save_for_backward(*variables)
return new_h, new_cell
@staticmethod
def backward(ctx, grad_h, grad_cell):
outputs = lltm_cpp.backward(
grad_h.contiguous(), grad_cell.contiguous(), *ctx.saved_tensors)
d_old_h, d_input, d_weights, d_bias, d_old_cell = outputs
return d_input, d_weights, d_bias, d_old_h, d_old_cell
class LLTM(torch.nn.Module):
def __init__(self, input_features, state_size):
super(LLTM, self).__init__()
self.input_features = input_features
self.state_size = state_size
self.weights = torch.nn.Parameter(
torch.empty(3 * state_size, input_features + state_size))
self.bias = torch.nn.Parameter(torch.empty(3 * state_size))
self.reset_parameters()
def reset_parameters(self):
stdv = 1.0 / math.sqrt(self.state_size)
for weight in self.parameters():
weight.data.uniform_(-stdv, +stdv)
def forward(self, input, state):
return LLTMFunction.apply(input, self.weights, self.bias, *state)
性能比较
现在,我们能够从 PyTorch 中使用和调用我们的 C++ 代码,我们可以运行一个小型基准测试来查看我们重写我们的 op 在 C++ 中获得了多少性能提升。我们将多次运行 LLTM 的正向和反向操作,并测量持续时间:
import time
import torch
batch_size = 16
input_features = 32
state_size = 128
X = torch.randn(batch_size, input_features)
h = torch.randn(batch_size, state_size)
C = torch.randn(batch_size, state_size)
rnn = LLTM(input_features, state_size)
forward = 0
backward = 0
for _ in range(100000):
start = time.time()
new_h, new_C = rnn(X, (h, C))
forward += time.time() - start
start = time.time()
(new_h.sum() + new_C.sum()).backward()
backward += time.time() - start
print('Forward: {:.3f} s | Backward {:.3f} s'.format(forward, backward))
如果我们用本帖开头用纯 Python 编写的原始 LLTM 运行此代码,我们会得到以下数字(在我的机器上):
Forward: 506.480 us | Backward 444.694 us
和我们的新 C++版本一起:
Forward: 349.335 us | Backward 443.523 us
我们已经可以看到正向函数的显著加速(超过 30%)。对于反向函数,也有加速,但不是特别明显。上面我写的反向传播并没有特别优化,肯定可以改进。此外,PyTorch 的自动微分引擎可以自动并行化计算图,整体上可能使用更高效的运算流程,并且也是用 C++实现的,所以预计会很快。尽管如此,这已经是一个不错的开始了。
GPU 设备上的性能
关于 PyTorch 的 ATen 后端的一个美妙事实是,它可以抽象化你正在运行的计算设备。这意味着我们为 CPU 编写的代码也可以在 GPU 上运行,并且单个操作会相应地调度到 GPU 优化的实现。对于像矩阵乘法(如 mm
或 addmm
)这样的操作,这是一个很大的优势。让我们看看使用 CUDA 张量运行我们的 C++代码能获得多少性能提升。我们的实现不需要任何更改,我们只需要将我们的张量放入 Python 的 GPU 内存中,要么在创建时添加 device=cuda_device
参数,要么在创建后使用 .to(cuda_device)
:
import torch
assert torch.cuda.is_available()
cuda_device = torch.device("cuda") # device object representing GPU
batch_size = 16
input_features = 32
state_size = 128
# Note the device=cuda_device arguments here
X = torch.randn(batch_size, input_features, device=cuda_device)
h = torch.randn(batch_size, state_size, device=cuda_device)
C = torch.randn(batch_size, state_size, device=cuda_device)
rnn = LLTM(input_features, state_size).to(cuda_device)
forward = 0
backward = 0
for _ in range(100000):
start = time.time()
new_h, new_C = rnn(X, (h, C))
torch.cuda.synchronize()
forward += time.time() - start
start = time.time()
(new_h.sum() + new_C.sum()).backward()
torch.cuda.synchronize()
backward += time.time() - start
print('Forward: {:.3f} us | Backward {:.3f} us'.format(forward * 1e6/1e5, backward * 1e6/1e5))
再次将我们的纯 PyTorch 代码与我们的 C++版本进行比较,现在两者都在 CUDA 设备上运行,我们再次看到了性能提升。对于 Python/PyTorch:
Forward: 187.719 us | Backward 410.815 us
以及 C++/ATen:
Forward: 149.802 us | Backward 393.458 us
与非 CUDA 代码相比,这是一个很大的速度提升。然而,我们可以通过编写自定义 CUDA 内核来从我们的 C++代码中提取更多的性能,我们将在不久的将来深入探讨。在那之前,让我们讨论另一种构建 C++扩展的方法。
JIT 编译扩展
之前,我提到了构建 C++ 扩展的两种方式:使用 setuptools
或即时编译(JIT)。已经介绍了前者,现在让我们详细说明后者。JIT 编译机制提供了一种通过调用 PyTorch API 中的简单函数 torch.utils.cpp_extension.load()
来动态编译和加载扩展的方法。对于 LLTM,这看起来就像这样:
from torch.utils.cpp_extension import load
lltm_cpp = load(name="lltm_cpp", sources=["lltm.cpp"])
在这里,我们向函数提供与 setuptools
相同的信息。在后台,这将执行以下操作:
创建一个临时目录
/tmp/torch_extensions/lltm
,将 Ninja 构建文件输出到该临时目录,
将源文件编译成共享库,
将此共享库导入为 Python 模块。
事实上,如果您将 verbose=True
传递给 cpp_extension.load()
,您将了解到整个过程:
Using /tmp/torch_extensions as PyTorch extensions root...
Emitting ninja build file /tmp/torch_extensions/lltm_cpp/build.ninja...
Building extension module lltm_cpp...
Loading extension module lltm_cpp...
生成的 Python 模块将与 setuptools 生成的完全相同,但消除了需要维护单独的 setup.py
构建文件的要求。如果您的设置更复杂,并且您确实需要 setuptools
的全部功能,您可以编写自己的 setup.py
,但在许多情况下,这种即时编译技术就足够了。第一次运行此行时,由于扩展在后台编译,所以会花费一些时间。由于我们使用 Ninja 构建系统构建您的源代码,因此重新编译是增量式的,因此当您第二次运行 Python 模块时重新加载扩展的速度快且开销低,前提是您没有更改扩展的源文件。
编写混合 C++/CUDA 扩展
要真正将我们的实现提升到下一个层次,我们可以手动编写前向和反向传播的部分,使用自定义 CUDA 内核。对于 LLTM,这具有特别有效的潜力,因为序列中有大量的逐点操作,这些操作都可以在一个 CUDA 内核中融合和并行化。让我们看看我们如何编写这样的 CUDA 内核,并使用这个扩展机制将其与 PyTorch 集成。
编写 CUDA 扩展的一般策略是首先编写一个 C++文件,该文件定义了将从 Python 中调用的函数,并使用 pybind11 将这些函数绑定到 Python。此外,该文件还将声明在 CUDA( .cu
)文件中定义的函数。然后,C++函数将执行一些检查,最终将其调用转发到 CUDA 函数。在 CUDA 文件中,我们编写实际的 CUDA 内核。然后, cpp_extension
包将负责使用 C++编译器如 gcc
编译 C++源代码,使用 NVIDIA 的 nvcc
编译器编译 CUDA 源代码。这确保了每个编译器负责编译它最擅长的文件。最终,它们将被链接成一个共享库,该库可供我们从 Python 代码中使用。
我们将从 C++文件开始,例如,我们可以将其称为 lltm_cuda.cpp
。
#include <torch/extension.h>
#include <vector>
// CUDA forward declarations
std::vector<torch::Tensor> lltm_cuda_forward(
torch::Tensor input,
torch::Tensor weights,
torch::Tensor bias,
torch::Tensor old_h,
torch::Tensor old_cell);
std::vector<torch::Tensor> lltm_cuda_backward(
torch::Tensor grad_h,
torch::Tensor grad_cell,
torch::Tensor new_cell,
torch::Tensor input_gate,
torch::Tensor output_gate,
torch::Tensor candidate_cell,
torch::Tensor X,
torch::Tensor gate_weights,
torch::Tensor weights);
// C++ interface
#define CHECK_CUDA(x) TORCH_CHECK(x.device().is_cuda(), #x " must be a CUDA tensor")
#define CHECK_CONTIGUOUS(x) TORCH_CHECK(x.is_contiguous(), #x " must be contiguous")
#define CHECK_INPUT(x) CHECK_CUDA(x); CHECK_CONTIGUOUS(x)
std::vector<torch::Tensor> lltm_forward(
torch::Tensor input,
torch::Tensor weights,
torch::Tensor bias,
torch::Tensor old_h,
torch::Tensor old_cell) {
CHECK_INPUT(input);
CHECK_INPUT(weights);
CHECK_INPUT(bias);
CHECK_INPUT(old_h);
CHECK_INPUT(old_cell);
return lltm_cuda_forward(input, weights, bias, old_h, old_cell);
}
std::vector<torch::Tensor> lltm_backward(
torch::Tensor grad_h,
torch::Tensor grad_cell,
torch::Tensor new_cell,
torch::Tensor input_gate,
torch::Tensor output_gate,
torch::Tensor candidate_cell,
torch::Tensor X,
torch::Tensor gate_weights,
torch::Tensor weights) {
CHECK_INPUT(grad_h);
CHECK_INPUT(grad_cell);
CHECK_INPUT(input_gate);
CHECK_INPUT(output_gate);
CHECK_INPUT(candidate_cell);
CHECK_INPUT(X);
CHECK_INPUT(gate_weights);
CHECK_INPUT(weights);
return lltm_cuda_backward(
grad_h,
grad_cell,
new_cell,
input_gate,
output_gate,
candidate_cell,
X,
gate_weights,
weights);
}
PYBIND11_MODULE(TORCH_EXTENSION_NAME, m) {
m.def("forward", &lltm_forward, "LLTM forward (CUDA)");
m.def("backward", &lltm_backward, "LLTM backward (CUDA)");
}
如您所见,这主要是模板代码,检查和转发到我们在 CUDA 文件中定义的函数。我们将把这个文件命名为 lltm_cuda_kernel.cu
(注意 .cu
扩展名!)。NVCC 可以合理地编译 C++11,因此我们仍然可以使用 ATen 和 C++标准库(但不能使用 torch.h
)。请注意, setuptools
无法处理具有相同名称但不同扩展名的文件,因此如果您使用 setup.py
方法而不是 JIT 方法,您必须给您的 CUDA 文件一个与您的 C++文件不同的名称(对于 JIT 方法, lltm.cpp
和 lltm.cu
就可以正常工作)。让我们先简要看看这个文件的样子:
#include <torch/extension.h>
#include <cuda.h>
#include <cuda_runtime.h>
#include <vector>
template <typename scalar_t>
__device__ __forceinline__ scalar_t sigmoid(scalar_t z) {
return 1.0 / (1.0 + exp(-z));
}
在这里,我们可以看到我刚才描述的头文件,以及我们正在使用 CUDA 特定的声明如 __device__
和 __forceinline__
以及函数如 exp
。让我们继续添加一些我们需要的辅助函数:
template <typename scalar_t>
__device__ __forceinline__ scalar_t d_sigmoid(scalar_t z) {
const auto s = sigmoid(z);
return (1.0 - s) * s;
}
template <typename scalar_t>
__device__ __forceinline__ scalar_t d_tanh(scalar_t z) {
const auto t = tanh(z);
return 1 - (t * t);
}
template <typename scalar_t>
__device__ __forceinline__ scalar_t elu(scalar_t z, scalar_t alpha = 1.0) {
return fmax(0.0, z) + fmin(0.0, alpha * (exp(z) - 1.0));
}
template <typename scalar_t>
__device__ __forceinline__ scalar_t d_elu(scalar_t z, scalar_t alpha = 1.0) {
const auto e = exp(z);
const auto d_relu = z < 0.0 ? 0.0 : 1.0;
return d_relu + (((alpha * (e - 1.0)) < 0.0) ? (alpha * e) : 0.0);
}
要现在实际实现一个函数,我们还需要两样东西:一个执行我们不希望手动编写的操作并调用 CUDA 内核的函数,以及我们想要加速的实际 CUDA 内核。对于前向传播,第一个函数应该看起来像这样:
std::vector<torch::Tensor> lltm_cuda_forward(
torch::Tensor input,
torch::Tensor weights,
torch::Tensor bias,
torch::Tensor old_h,
torch::Tensor old_cell) {
auto X = torch::cat({old_h, input}, /*dim=*/1);
auto gates = torch::addmm(bias, X, weights.transpose(0, 1));
const auto batch_size = old_cell.size(0);
const auto state_size = old_cell.size(1);
auto new_h = torch::zeros_like(old_cell);
auto new_cell = torch::zeros_like(old_cell);
auto input_gate = torch::zeros_like(old_cell);
auto output_gate = torch::zeros_like(old_cell);
auto candidate_cell = torch::zeros_like(old_cell);
const int threads = 1024;
const dim3 blocks((state_size + threads - 1) / threads, batch_size);
AT_DISPATCH_FLOATING_TYPES(gates.type(), "lltm_forward_cuda", ([&] {
lltm_cuda_forward_kernel<scalar_t><<<blocks, threads>>>(
gates.data<scalar_t>(),
old_cell.data<scalar_t>(),
new_h.data<scalar_t>(),
new_cell.data<scalar_t>(),
input_gate.data<scalar_t>(),
output_gate.data<scalar_t>(),
candidate_cell.data<scalar_t>(),
state_size);
}));
return {new_h, new_cell, input_gate, output_gate, candidate_cell, X, gates};
}
这里的主要关注点是 AT_DISPATCH_FLOATING_TYPES
宏和内核启动(由 <<<...>>>
指示)。虽然 ATen 抽象掉了我们处理的张量的设备和数据类型,但在运行时,张量仍然由具体设备上的具体类型的内存支持。因此,我们需要一种方法来确定运行时张量的类型,然后选择性地调用具有相应正确类型签名的函数。如果手动完成,从概念上讲将类似于以下内容:
switch (tensor.type().scalarType()) {
case torch::ScalarType::Double:
return function<double>(tensor.data<double>());
case torch::ScalarType::Float:
return function<float>(tensor.data<float>());
...
}
AT_DISPATCH_FLOATING_TYPES
的目的是为我们处理这种调度。它接受一个类型(在我们的例子中是 gates.type()
),一个名称(用于错误消息)和一个 lambda 函数。在这个 lambda 函数内部,类型别名 scalar_t
可用,定义为在该上下文中张量实际运行时的类型。因此,如果我们有一个模板函数(我们的 CUDA 内核将是),我们可以用这个 scalar_t
别名实例化它,并调用正确的函数。在这种情况下,我们还想检索张量的数据指针,作为该 scalar_t
类型的指针。如果您想对所有类型进行调度,而不仅仅是浮点类型( Float
和 Double
),则可以使用 AT_DISPATCH_ALL_TYPES
。
注意,我们使用纯 ATen 执行一些操作。这些操作仍然会在 GPU 上运行,但使用 ATen 的默认实现。这样做是有意义的,因为 ATen 会使用高度优化的例程来处理矩阵乘法(例如 addmm
)或卷积等,这些操作如果由我们自己实现和改进将会更加困难。
至于内核启动本身,我们在这里指定每个 CUDA 块将有 1024 个线程,整个 GPU 网格将分成尽可能多的块,每个块包含 1 x 1024
个线程,以填充我们的矩阵,每个组件一个线程。例如,如果我们的状态大小为 2048,批大小为 4,我们将启动总共 4 x 2 = 8
个块,每个块包含 1024 个线程。如果你之前从未听说过 CUDA 的“块”或“网格”,阅读一些 CUDA 的入门资料可能会有所帮助。
实际的 CUDA 内核相当简单(如果你之前曾编程过 GPU):
template <typename scalar_t>
__global__ void lltm_cuda_forward_kernel(
const scalar_t* __restrict__ gates,
const scalar_t* __restrict__ old_cell,
scalar_t* __restrict__ new_h,
scalar_t* __restrict__ new_cell,
scalar_t* __restrict__ input_gate,
scalar_t* __restrict__ output_gate,
scalar_t* __restrict__ candidate_cell,
size_t state_size) {
const int column = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x;
const int index = blockIdx.y * state_size + column;
const int gates_row = blockIdx.y * (state_size * 3);
if (column < state_size) {
input_gate[index] = sigmoid(gates[gates_row + column]);
output_gate[index] = sigmoid(gates[gates_row + state_size + column]);
candidate_cell[index] = elu(gates[gates_row + 2 * state_size + column]);
new_cell[index] =
old_cell[index] + candidate_cell[index] * input_gate[index];
new_h[index] = tanh(new_cell[index]) * output_gate[index];
}
}
最有趣的是,我们能够完全并行地计算我们门控矩阵中每个单独组件的所有这些点积操作。如果你想象一下,如果需要用一个大型的 for
循环逐个处理一百万个元素,你就能理解为什么这会快得多。
使用访问器
您可以在 CUDA 内核中看到,我们直接使用正确类型的指针。实际上,在 CUDA 内核中直接使用高级无类型张量将非常低效。
然而,这以易用性和可读性为代价,尤其是在处理高维数据时。在我们的例子中,例如,我们知道连续的 gates
张量有 3 个维度:
批量,
batch_size
的大小和3*state_size
的步长行,
3
的大小和state_size
的步长索引,
state_size
的大小和1
的步长
那么我们如何在内核中访问 gates[n][row][column]
这个元素呢?实际上,你需要步长来通过一些简单的算术来访问你的元素。
gates.data<scalar_t>()[n*3*state_size + row*state_size + column]
除了冗长之外,这个表达式还需要显式地知道步长,因此需要将其作为参数传递给内核函数。你可以看到,在内核函数接受多个不同大小的张量时,你将得到一个非常长的参数列表。
幸运的是,ATen 提供了通过单个动态检查来确保 Tensor 类型和维数的访问器。访问器随后暴露了一个 API,可以高效地访问 Tensor 元素,而无需转换为单个指针:
torch::Tensor foo = torch::rand({12, 12});
// assert foo is 2-dimensional and holds floats.
auto foo_a = foo.accessor<float,2>();
float trace = 0;
for(int i = 0; i < foo_a.size(0); i++) {
// use the accessor foo_a to get tensor data.
trace += foo_a[i][i];
}
访问器对象具有相对高级的接口,包括 .size()
和 .stride()
方法以及多维索引。 .accessor<>
接口旨在高效地在 CPU 张量上访问数据。对于 CUDA 张量,对应的是 packed_accessor64<>
和 packed_accessor32<>
,它们产生带有 64 位或 32 位整数索引的打包访问器。
与访问器相比,基本区别在于打包访问器在其结构内部复制大小和步长数据,而不是指向它。这允许我们将它传递给 CUDA 内核函数,并在其中使用其接口。
我们可以设计一个函数,该函数接受打包访问器而不是指针。
__global__ void lltm_cuda_forward_kernel(
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits> gates,
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> old_cell,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> new_h,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> new_cell,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> input_gate,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> output_gate,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> candidate_cell)
让我们来分解这里使用的模板。前两个参数 scalar_t
和 2
与常规访问器相同。参数 torch::RestrictPtrTraits
表示必须使用 __restrict__
关键字。注意,我们还使用了 PackedAccessor32
变体,它将大小和步长存储在 int32_t
中。这很重要,因为使用 64 位变体( PackedAccessor64
)可能会使内核变慢。
函数声明变为
template <typename scalar_t>
__global__ void lltm_cuda_forward_kernel(
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits> gates,
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> old_cell,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> new_h,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> new_cell,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> input_gate,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> output_gate,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> candidate_cell) {
//batch index
const int n = blockIdx.y;
// column index
const int c = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x;
if (c < gates.size(2)){
input_gate[n][c] = sigmoid(gates[n][0][c]);
output_gate[n][c] = sigmoid(gates[n][1][c]);
candidate_cell[n][c] = elu(gates[n][2][c]);
new_cell[n][c] =
old_cell[n][c] + candidate_cell[n][c] * input_gate[n][c];
new_h[n][c] = tanh(new_cell[n][c]) * output_gate[n][c];
}
}
实现更加易于阅读!然后通过在主机函数中创建带有 .packed_accessor32<>
方法的打包访问器来调用此函数。
std::vector<torch::Tensor> lltm_cuda_forward(
torch::Tensor input,
torch::Tensor weights,
torch::Tensor bias,
torch::Tensor old_h,
torch::Tensor old_cell) {
auto X = torch::cat({old_h, input}, /*dim=*/1);
auto gate_weights = torch::addmm(bias, X, weights.transpose(0, 1));
const auto batch_size = old_cell.size(0);
const auto state_size = old_cell.size(1);
auto gates = gate_weights.reshape({batch_size, 3, state_size});
auto new_h = torch::zeros_like(old_cell);
auto new_cell = torch::zeros_like(old_cell);
auto input_gate = torch::zeros_like(old_cell);
auto output_gate = torch::zeros_like(old_cell);
auto candidate_cell = torch::zeros_like(old_cell);
const int threads = 1024;
const dim3 blocks((state_size + threads - 1) / threads, batch_size);
AT_DISPATCH_FLOATING_TYPES(gates.type(), "lltm_forward_cuda", ([&] {
lltm_cuda_forward_kernel<scalar_t><<<blocks, threads>>>(
gates.packed_accessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits>(),
old_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
new_h.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
new_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
input_gate.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
output_gate.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
candidate_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>());
}));
return {new_h, new_cell, input_gate, output_gate, candidate_cell, X, gates};
}
反向传播遵循类似的模式,这里不再详细说明:
template <typename scalar_t>
__global__ void lltm_cuda_backward_kernel(
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> d_old_cell,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits> d_gates,
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> grad_h,
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> grad_cell,
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> new_cell,
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> input_gate,
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> output_gate,
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> candidate_cell,
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits> gate_weights) {
//batch index
const int n = blockIdx.y;
// column index
const int c = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x;
if (c < d_gates.size(2)){
const auto d_output_gate = tanh(new_cell[n][c]) * grad_h[n][c];
const auto d_tanh_new_cell = output_gate[n][c] * grad_h[n][c];
const auto d_new_cell =
d_tanh(new_cell[n][c]) * d_tanh_new_cell + grad_cell[n][c];
d_old_cell[n][c] = d_new_cell;
const auto d_candidate_cell = input_gate[n][c] * d_new_cell;
const auto d_input_gate = candidate_cell[n][c] * d_new_cell;
d_gates[n][0][c] =
d_input_gate * d_sigmoid(gate_weights[n][0][c]);
d_gates[n][1][c] =
d_output_gate * d_sigmoid(gate_weights[n][1][c]);
d_gates[n][2][c] =
d_candidate_cell * d_elu(gate_weights[n][2][c]);
}
}
std::vector<torch::Tensor> lltm_cuda_backward(
torch::Tensor grad_h,
torch::Tensor grad_cell,
torch::Tensor new_cell,
torch::Tensor input_gate,
torch::Tensor output_gate,
torch::Tensor candidate_cell,
torch::Tensor X,
torch::Tensor gates,
torch::Tensor weights) {
auto d_old_cell = torch::zeros_like(new_cell);
auto d_gates = torch::zeros_like(gates);
const auto batch_size = new_cell.size(0);
const auto state_size = new_cell.size(1);
const int threads = 1024;
const dim3 blocks((state_size + threads - 1) / threads, batch_size);
AT_DISPATCH_FLOATING_TYPES(X.type(), "lltm_backward_cuda", ([&] {
lltm_cuda_backward_kernel<scalar_t><<<blocks, threads>>>(
d_old_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
d_gates.packed_accessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits>(),
grad_h.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
grad_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
new_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
input_gate.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
output_gate.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
candidate_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
gates.packed_accessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits>());
}));
auto d_gate_weights = d_gates.reshape({batch_size, 3*state_size});
auto d_weights = d_gate_weights.t().mm(X);
auto d_bias = d_gate_weights.sum(/*dim=*/0, /*keepdim=*/true);
auto d_X = d_gate_weights.mm(weights);
auto d_old_h = d_X.slice(/*dim=*/1, 0, state_size);
auto d_input = d_X.slice(/*dim=*/1, state_size);
return {d_old_h, d_input, d_weights, d_bias, d_old_cell, d_gates};
}
将 C++/CUDA 操作集成到 PyTorch 中
将我们具有 CUDA 功能的操作与 PyTorch 集成再次非常简单。如果您想编写一个 setup.py
脚本,它可能看起来像这样:
from setuptools import setup
from torch.utils.cpp_extension import BuildExtension, CUDAExtension
setup(
name='lltm',
ext_modules=[
CUDAExtension('lltm_cuda', [
'lltm_cuda.cpp',
'lltm_cuda_kernel.cu',
])
],
cmdclass={
'build_ext': BuildExtension
})
我们现在不再使用 CppExtension()
,而是使用 CUDAExtension()
。我们只需指定 .cu
文件以及 .cpp
文件即可——库会为您处理所有这些繁琐的工作。JIT 机制甚至更简单:
from torch.utils.cpp_extension import load
lltm = load(name='lltm', sources=['lltm_cuda.cpp', 'lltm_cuda_kernel.cu'])
性能比较
我们的希望是,通过将代码中的逐点操作并行化和融合 CUDA,可以提高我们的 LLTM 的性能。让我们看看这是否成立。我们可以运行前面列出的代码来运行基准测试。我们之前最快的版本是基于 CUDA 的 C++代码:
Forward: 149.802 us | Backward 393.458 us
现在我们有了自定义的 CUDA 内核:
Forward: 129.431 us | Backward 304.641 us
性能再次提升!
结论 ¶
现在您应该已经对 PyTorch 的 C++扩展机制有了很好的了解,并且知道了使用它们的动机。您可以在本笔记中找到显示的代码示例。如果您有任何问题,请使用论坛。同时,如果遇到任何问题,请务必查看我们的常见问题解答。关于为 AMD ROCm 编写扩展的博客可以在这里找到。